教員情報 - 香川　亘

1.	著書	第10講 DNA損傷と修復分子生物学 15講基礎編 211-235頁（共著） 2024/10
2.	論文	Heavy water inhibits DNA double-strand break repairs and disturbs cellular transcription, presumably via quantum-level mechanisms of kinetic isotope effects on hydrolytic enzyme reactions. PLoS One 19(10),pp.e0309689 （共著） 2024/10
3.	論文	Structural basis of damaged nucleotide recognition by transcribing RNA polymerase II in the nucleosome. J. Mol. Biol. 435(13),pp.168130 （共著） 2023/04
4.	論文	Biochemical characterization of the RNA-binding and RNA-DNA strand exchange activities of the human RAD52 protein. The Journal of Biochemistry 174(1),pp.59-69 （共著） 2023/02
5.	論文	The cryo-EM structure of full-length RAD52 protein contains an undecameric ring FEBS Open Bio 13(3),pp.408-418 （共著） 2023/01
6.	論文	Biochemical characterization of RAD52-mediated D-loop formation using fluorophore-labeled DNA substrates bioRxiv （共著） 2022/02
7.	論文	Structural basis for DNA sequence recognition by pioneer factors in nucleosomes Curr. Opin. Struct. Biol. 71,pp.59-64 （共著） 2021/07
8.	論文	Human SIRT2 and SIRT3 deacetylases function in DNA homologous recombinational repair. Genes Cells （共著） 2021/02
9.	論文	DNA replication machinery prevents Rad52-dependent single-strand annealing that leads to gross chromosomal rearrangements at centromeres Commun. Biol. 3,pp.202 （共著） 2020/04
10.	論文	Improved methods for preparing the telomere tethering complex Bqt1-Bqt2 for structural studies. Protein J. 39,pp.174-181 （共著） 2020/04
11.	論文	Structure determination of the nucleosome core particle by selenium SAD phasing Acta Cryst. D （共著） 2019/09
12.	論文	A novel mode of DnaA-DnaA interaction promotes ADP dissociation for reactivation of replication initiation activity. Nucleic Acids Res. （共著） 2019/09
13.	論文	Structural Basis of Homology-Directed DNA Repair Mediated by RAD52 iScience 3,pp.50-62 （共著） 2018/05
14.	論文	Novel function of HATs and HDACs in homologous recombination through acetylation of human RAD52 at double-strand break sites. PLoS Genetics 14(3),pp.e1007277 （共著） 2018/03
15.	論文	Structure of the human DNA-repair protein RAD52 containing surface mutations Acta Cryst. F 72,pp.598-603 （共著） 2016/08
16.	論文	Crystal structure of the nucleosome containing ultraviolet light-induced cyclobutane pyrimidine dimer. Biochem. Biophys. Res. Commun. 471,pp.117-122 （共著） 2016/02
17.	論文	Histone H3.5 forms an unstable nucleosome and accumulates around transcription start sites in human testis. Epigenetics Chromatin 9,pp.2 （共著） 2016/01
18.	論文	Structural basis of pyrimidine-pyrimidone (6-4) photoproduct recognition by UV-DDB in the nucleosome. Sci. Rep. 5,pp.16330 （共著） 2015/11
19.	論文	Structure of RizA, an L-amino-acid ligase from Bacillus subtilis. Acta Crystallogr. F Struct. Biol. Commun. 71,pp.1125-1130 （共著） 2015/09
20.	論文	Crystal structure and stable property of the cancer-associated heterotypic nucleosome containing CENP-A and H3.3. Sci. Rep. 4,pp.7115 （共著） 2014/11
21.	論文	出芽酵母Rad52の相同組換えにおける分子メカニズム生化学 86(5),693-697頁（共著） 2014/10
22.	論文	Functional analyses of the C-terminal half of the Saccharomyces cerevisiae Rad52 protein. Nucleic Acids Res. 42,pp.941-951 （共著） 2014/01
23.	論文	Structural polymorphism in the L1 loop regions of human H2A.Z.1 and H2A.Z.2 Acta Cryst. D 69,pp.2431-2439 （共著） 2013/12
24.	論文	Contribution of histone N-terminal tails to the structure and stability of nucleosomes. FEBS Open Bio. 3,pp.363-369 （共著） 2013/08
25.	論文	Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of the secreted protein Athe_0614 from Caldicellulosiruptor bescii. Acta Cryst. F 69,pp.438-440 （共著） 2013/04
26.	論文	Purification and characterization of the fission yeast telomere clustering factors, Bqt1 and Bqt2 Protein Expr. Purif. 88(2),pp.207-213 （共著） 2013/04
27.	論文	Current progress on structural studies of nucleosomes containing histone H3 variants Curr. Opin. Struct. Biol. 23(1),pp.109-115 （共著） 2013/02
28.	論文	Histone chaperone activity of Fanconi anemia proteins, FANCD2 and FANCI, is required for DNA crosslink repair EMBO J. 31(17),pp.3524-3536 （共著） 2012/08
29.	論文	RAD51 plays a crucial role in halting cell death program induced by ionizing radiation in bovine oocytes Biol. Reprod. 86(3),pp.76 （共著） 2012/03
30.	論文	Comparison between the CENP-A and histone H3 structures in nucleosomes Nucleus 3(1),pp.6-11 （共著） 2012/01
31.	論文	Structural basis for the DNA-binding activity of the bacterial beta-propeller protein YncE Acta Cryst. D 67,pp.1045-1053 （共著） 2011/12
32.	論文	Comprehensive structural analysis of mutant nucleosomes containing lysine to glutamine (KQ) substitutions in the H3 and H4 histone-fold domains Biochemistry 50(36),pp.7822-7832 （共著） 2011/09
33.	論文	Crystal structure of the human centromeric nucleosome containing CENP-A Nature 476(7359),pp.232-235 （共著） 2011/07
34.	論文	Structures of human nucleosomes containing major histone H3 variants Acta Cryst. D 67,pp.578-583 （共著） 2011/06
35.	論文	Vital roles of the second DNA-binding site of Rad52 protein in yeast homologous recombination J. Biol. Chem. 286(20),pp.17607-17617 （共著） 2011/05
36.	論文	Structural and biochemical analyses of the human PAD4 variant encoded by a functional haplotype gene Acta Cryst. D 67,pp.112-118 （共著） 2011/02
37.	論文	Structural basis of instability of the nucleosome containing a testis-specific histone variant, human H3T Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 107(23),pp.10454-10459 （共著） 2010/06
38.	論文	The putative nuclear localization signal of the human RAD52 protein is a potential sumoylation site J. Biochem. 147(6),pp.833-842 （共著） 2010/06
39.	論文	発癌防御に重要な相同組換えの分子機構最新医学 65,76-88頁（共著） 2010/06
40.	論文	Dynamics in the transmission of genetic information: from meiosis to postmeiotic events FEBS J. 277(3),pp.564 （共著） 2010/02
41.	論文	Enhancing survival of mouse oocytes following chemotherapy or aging by targeting Bax and Rad51 PLoS One 5(2),pp.e9204 （共著） 2010/02
42.	論文	From meiosis to postmeiotic events: uncovering the molecular roles of the meiosis-specific recombinase Dmc1 FEBS J. 277(3),pp.590-598 （共著） 2010/02
43.	論文	Biochemical analysis of the N-terminal domain of human RAD54B Nucleic Acids Res. 36(17),pp.5441-5450 （共著） 2008/10
44.	論文	Identification of a second DNA binding site in the human Rad52 protein J. Biol. Chem. 283(35),pp.24264-24273 （共著） 2008/08
45.	論文	Structural and functional analyses of the DMC1-M200V polymorphism found in the human population Nucleic Acids Res. 36(12),pp.4181-4190 （共著） 2008/07
46.	論文	A common mechanism for the ATP-DnaA-dependent formation of open complexes at the replication origin J. Biol. Chem. 283(13),pp.8351-8362 （共著） 2008/03
47.	論文	The interaction of DiaA and DnaA regulates the replication cycle in E. coli by directly promoting ATP DnaA-specific initiation complexes Genes Dev. 21(16),pp.2083-2099 （共著） 2007/08
48.	論文	Genetic variance modifies apoptosis susceptibility in mature oocytes via alterations in DNA repair capacity and mitochondrial ultrastructure Cell Death Differ. 14(3),pp.524-533 （共著） 2007/03
49.	論文	Stimulation of Dmc1-mediated DNA strand exchange by the human Rad54B protein Nucleic Acids Res. 34(16),pp.4429-4437 （共著） 2006/08
50.	論文	Role of the N-terminal domain of the human DMC1 protein in octamer formation and DNA binding J. Biol. Chem. 280(31),pp.28382-28387 （共著） 2005/08
51.	論文	Mutational analyses of the human Rad51-Tyr315 residue, a site for phosphorylation in leukaemia cells Genes Cells 9(9),pp.781-790 （共著） 2004/09
52.	論文	Preferential binding to branched DNA strands and strand-annealing activity of the human Rad51B, Rad51C, Rad51D and Xrcc2 protein complex Nucleic Acids Res. 32(8),pp.2556-2565 （共著） 2004/05
53.	論文	Structural basis for octameric ring formation and DNA interaction of the human homologous-pairing protein Dmc1 Mol. Cell 14(3),pp.363-374 （共著） 2004/05
54.	論文	ヒトDNA組換え酵素RAD52の11量体リング構造日本結晶学会誌 45(3),119-123頁（共著） 2003/06
55.	論文	Crystal structure of the homologous-pairing domain from the human Rad52 recombinase in the undecameric form Mol. Cell 10(2),pp.359-371 （共著） 2002/08
56.	論文	Homologous pairing and ring and filament structure formation activities of the human Xrcc2*Rad51D complex J. Biol. Chem. 277(16),pp.14315-14320 （共著） 2002/04
57.	論文	Human Rad54B is a double-stranded DNA-dependent ATPase and has biochemical properties different from its structural homolog in yeast, Tid1/Rdh54 Nucleic Acids Res. 30(6),pp.1346-1353 （共著） 2002/03
58.	論文	Homologous pairing promoted by the human Rad52 protein J. Biol. Chem. 276(37),pp.35201-35208 （共著） 2001/09
59.	論文	Homologous-pairing activity of the human DNA-repair proteins Xrcc3.Rad51C Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 98(10),pp.5538-5543 （共著） 2001/05
60.	論文	Human Rad51 amino acid residues required for Rad52 binding J. Mol. Biol. 291(3),pp.537-548 （共著） 1999/08
61.	論文	Key determinants of the invasion mechanism of melanoma. Role for a new signaling pathway Adv. Exp. Med. Biol. 407,pp.303-310 （共著） 1997
62.	論文	12-Lipoxygenase in A431 cells: genetic identity, modulation of expression, and intracellular localization Exp. Cell Res. 228(2),pp.197-205 （共著） 1996/11
63.	論文	Activity and protein distribution of 12-lipoxygenase in HEL cells: induction of membrane-association by phorbol ester TPA, modulation of activity by glutathione and 13-HPODE, and Ca(2+)-dependent translocation to membranes Prostaglandins 46(6),pp.471-477 （共著） 1993/12
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■ 研究課題・受託研究・科研費

1.	2025/04～2028/03	非分裂細胞におけるDNA二重鎖切断修復の分子基盤の解明基盤研究（B）
2.	2025/04～2028/03	アポトーシス関連因子によるDNA二重鎖切断修復の制御機構基盤研究（C）
3.	2023/04～2028/03	クロマチンにおけるDNA修復機構の構造基盤の解明基盤研究（S）
4.	2023/04～2026/03	DNA修復特性を用いたがん治療耐性に対する制御機構の解明基盤研究（B）
5.	2022/04～2025/03	液-液相分離を基盤としたDNA二重鎖切断修復機構の解明基盤研究（B）
6.	2020/04～2023/03	クロマチン上で起こる転写と共役した二重鎖切断修復の分子機構の解明基盤研究（A）
7.	2019/04～2022/03	ゲノム反復配列上で起こる二重鎖切断修復の分子機構の解明基盤研究（C）
8.	2018/04～2019/03	ヌクレオソームダイナミクスの分子機構に関する研究競争的資金等の外部資金による研究
9.	2017/11～2019/03	DNA修復酵素RAD52を標的とした抗がん剤の開発競争的資金等の外部資金による研究
10.	2017/04～2018/03	ヌクレオソームダイナミクスの分子機構に関する研究競争的資金等の外部資金による研究
11.	2016/04～2018/03	ヌクレオソームの多様な構造を解析する技術の開発新学術領域研究
12.	2016/04～2017/03	ヌクレオソームダイナミクスの分子機構に関する研究競争的資金等の外部資金による研究
13.	2014/04～2016/03	ヌクレオソームの多様な構造を解析する技術の開発新学術領域研究
14.	2012/04～2015/03	ヌクレオソーム上で起こるDNA相同検索の分子機構基盤研究（C）
15.	2010/04～2014/03	組換え酵素における天然変性領域の機能新学術領域研究
16.	2009/04～2011/03	ＲＡＤ５２の組換え活性の分子機構に関する研究若手研究（B）
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■ 学歴

1.	2000/04～2003/03	東京大学大学院理学系研究科生物化学博士課程修了博士（理学）
2.	1998/04～2000/03	東京大学大学院理学系研究科生物化学修士課程修了修士（理学）
3.	1992/09～1997/06	Wayne State University College of Liberal Arts & Sciences 卒業 Bachelor of Sciences, Bachelor of Arts

■ 職歴

1.	2023/04～	明星大学理工学部総合理工学科教授
2.	2019/04～2023/03	明星大学理工学部総合理工学科（生命科学・化学系）教授
3.	2012/04～2019/03	明星大学理工学部総合理工学科（生命科学・化学系）准教授
4.	2010/04～2012/03	早稲田大学理工学術院助教
5.	2009/04～2010/03	早稲田大学理工学術院次席研究員
6.	2006/04～2009/03	理化学研究所生命分子システム基盤研究領域研究員
7.	2003/04～2006/03	理化学研究所ゲノム科学総合研究センター基礎科学特別研究員
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■ 教育上の能力

●教育方法の実践例
1.	2015/04/01～	講義資料・課題・演習問題のインターネット上での公開
●作成した教科書、教材
1.	2012/04/01～	化学・生命科学実験３の教材の作成

■ 授業科目

1.	【院】修士論文
2.	【院】化学研究３
3.	【院】化学研究４
4.	【院】生化学演習・実験E
5.	【院】生化学演習・実験F
6.	【院】生物物理特論A
7.	【院】生物物理特論B
8.	ゼミナール
9.	ゼミナール１
10.	ゼミナール２
11.	ナノ・バイオテクノロジー
12.	化学・生命科学基礎ゼミ
13.	化学・生命科学実験２
14.	卒業研究
15.	基礎物理化学
16.	基礎物理化学【再】
17.	応用物理化学
18.	構造生物学
19.	物理化学
20.	理工実験実習
21.	生化学１
22.	生物学概論
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■ 所属学会

1.		日本分子生物学会
2.		日本生化学会
3.		日本蛋白質科学会

■ プロフィール

細胞核の中で日常的に発生するDNA損傷がどのようなしくみによって修復されるのかを研究しています。DNA修復は複数種類のタンパク質が協力することによって達成されます。このしくみに迫るために，DNA修復ではたらくタンパク質がDNA修復反応の過程で形成するタンパク質・タンパク質複合体やタンパク質・DNA複合体に着目し，複合体の「形」から「機能」を明らかにする研究を行っています。複合体の構造には実に多くの機能に関するヒントが含まれています。これらのヒントをたよりに，変異体を用いた生化学的手法や物理化学的手法により，タンパク質の機能を詳細に理解することを目指しています。DNA修復ではたらくタンパク質は，ゲノムDNAの安定維持にかかせない存在ですが，変異などにより正常に機能しなくなったタンパク質はがんを誘発する可能性があり，生物にとって脅威となることがあります。わたしたちの研究で得られた知見が，がんなどの難病の治療法の開発に役立つことを期待しています。