スズキ ヨウコ
鈴木 陽子 所属 理工学部 総合理工学科 職種 准教授 |
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言語種別 | 英語 |
発行・発表の年月 | 2005/06 |
形態種別 | 学術雑誌 |
標題 | Modeling the Interplay between Geometrical and Energetic Effects in Protein Folding |
執筆形態 | 共著 |
掲載誌名 | J. Phys. Chem. B |
巻・号・頁 | 109,pp.16503-16510 |
著者・共著者 | Y.suzuki,J.N.Onuchic |
概要 | 蛋白質フォールディングの理論的な枠組みは、自由エネルギー関数を用いることによって構築される。この論文では、高分子理論をもとにした自由エネルギー関数のモデルの一般化を行った。一般化するにあたり、折り畳みにおいてみられる協同的な振る舞いに対応する因子を、形状エントロピーに対してはループ同士の相互作用として、内部エネルギーに対しては多体の相関として導入した。改良された解析モデルの有効性をCI2及びSH3 domein を例にとり、Cα Gōモデル-シュミレーションの結果と比較を行った。 |